引用管理

Citation Management は、K-Dense のオープンソース Claude Scientific Writer（MIT）に含まれるスキルで、研究執筆の地味な部分を担当します。論文探し、正確なメタデータの取得、きれいな BibTeX の作成、投稿前の参考文献チェックです。現行のバージョン 1.6 は、この流れのために Python スクリプトを 6 本同梱しています。

主な機能

• 検索：search_google_scholar.py と search_pubmed.py が Google Scholar と PubMed（NCBI E-utilities 経由）を検索し、結果を JSON で保存します。
• メタデータ抽出：doi_to_bibtex.py は DOI 1 件を変換、extract_metadata.py は DOI、PMID、arXiv ID、URL を単体またはリストで処理します。DOI の主な情報源は CrossRef です。
• 補完は必須：抽出後に巻・ページ・DOI が欠けた @article は、Parallel web スキルによるウェブ検索で補うか、理由を書いた note を付ける必要があります。
• 整形と検証：format_bibtex.py は .bib を整形して重複を除去、validate_citations.py は完全性、投稿先の書式（例：--venue nature）、LaTeX 原稿との一致を確認します。
• 安全上の注意：出版社のメタデータを信頼できない入力として扱い、シェル文字列ではなく引数リストで渡し、引用キーを ^[A-Za-z0-9]+$ で検証するよう指示しています。

使用シナリオ

• DOI や PMID の一覧を、書式の揃った 1 つの BibTeX ファイルにまとめる。
• 学位論文の参考文献から重複、無効な DOI、欠落フィールドを見つける。
• 投稿前にプレプリントを出版済みのジャーナル版へ差し替える。

料金と入手方法

MIT ライセンスで無料です。CrossRef、doi.org、arXiv は認証なしで照会します。任意の NCBI_EMAIL と NCBI_API_KEY は NCBI への識別とレート上限の引き上げに使い、OPENROUTER_API_KEY は任意の図生成専用です。

はじめに

1. Claude Code でプラグインを追加：/plugin marketplace add https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-writer、続けて /plugin install claude-scientific-writer。
2. pip install requests bibtexparser biopython（Google Scholar 検索には scholarly も追加）。
3. python scripts/doi_to_bibtex.py 10.1038/s41586-021-03819-2 を試し、python scripts/validate_citations.py references.bib --report report.txt で検証します。

制約：Google Scholar には公式 API がないため、検索はスクレイピング用ライブラリに頼り、レート制限やブロックを受けることがあります。抽出したメタデータにも誤りがありうるため、出典との抜き取り確認が求められます。

よくある質問

Zotero の代わりになりますか？

なりません。BibTeX の作成と整形が役割で、スキルの参考資料では文献管理ソフトを置き換えるのではなく pyzotero で Zotero へ書き出す方法を説明しています。

原稿内の引用も確認できますか？

できます。validate_citations.py --manuscript paper.tex で .bib と LaTeX ソース内の引用を照合します。

代替案

• Literature Review Skill：このスキルが支える系統的検索と統合のワークフロー。
• Research Lookup Skill：references.bib を含む検証済みの参考文献パケットを作成。
• Scholar Evaluation Skill：引用する研究の質を評価します。

まとめ

LaTeX で執筆し、Claude Code の中で BibTeX の抽出と検証をスクリプト化したいなら Citation Management が実用的です。出典が主張を本当に支えているかの判断はしないため、その確認は自分で行う必要があります。他の研究系スキルは スキル一覧 へ。